Distância genética entre linhagens avançadas de germoplasma de algodão com uso de marcadores de RAPD e microssatélites

Autores

  • Ivandilson Pessoa Pinto de Menezes Embrapa Algodão
  • Lúcia Vieira Hoffmann Embrapa Algodão
  • Milena Ferreira Alves Embrapa Algodão
  • Camilo de Lelis Morello Embrapa Algodão
  • Paulo Augusto Vianna Barroso Embrapa Algodão

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2008.v43.596

Palavras-chave:

Gossypium hirsutum, diversidade genética, marcadores RAPD, marcadores SSR

Resumo

O objetivo deste trabalho foi selecionar coefi cientes de similaridade para serem aplicados a conjuntos de genótipos de algodoeiro com baixa diversidade genética. Analisou-se um conjunto de 65 linhagens e
4 cultivares de algodão, com marcadores de RAPD e SSR, e estimou-se a similaridade genética de acordo com sete coefi cientes de similaridade: Coincidência Simples, Rogers & Tanimoto, Ochiai, Hamman, Jaccard, Dice
e Russel & Rao. A adequação dos coefi cientes ao conjunto de genótipos foi verifi cada por correlação entre as matrizes de distância, índice de consenso entre os dendrogramas e otimização de Tocher. As análises mostraram que o coefi ciente de Russel e Rao foi divergente em relação aos demais e seu uso não é recomendável. Entre os parâmetros usados para avaliar a qualidade de informação de cada coefi ciente, apenas o índice de consenso estabeleceu diferenças e os classifi cou em dois grupos: aquele em que a ausência simultânea é considerada e
aquele em que ela é desconsiderada. Considerando-se a presença de apenas dois alelos microssatélites por loco e os maiores índices de consenso, os coefi cientes de Coincidência Simples, Hamman e Rogers & Tanimoto devem ser preferidos, quando em conjuntos de genótipos de algodoeiro melhorados e com baixa diversidade.

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Publicado

2008-10-29

Como Citar

Menezes, I. P. P. de, Hoffmann, L. V., Alves, M. F., Morello, C. de L., & Barroso, P. A. V. (2008). Distância genética entre linhagens avançadas de germoplasma de algodão com uso de marcadores de RAPD e microssatélites. Pesquisa Agropecuária Brasileira, 43(10), 1339–1347. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2008.v43.596

Edição

Seção

GENÉTICA