New microsatellite markers developed from an enriched microsatellite common bean library

Authors

  • Juliana Morini Kupper Cardoso Instituto Agronômico
  • Paula Rodrigues Oblessuc Departamento de Genética e Evolução/ UNICAMP
  • Tatiana de Campos CBMEG e DGE / UNICAMP
  • Danilo Augusto Sforça CBMEG, UNICAMP
  • Sérgio Augusto Morais Carbonell Instituto Agronômico
  • Alisson Fernando Chioratto Instituto Agronômico
  • Eduardo Fernandes Formighieri LGE, UNICAMP
  • Anete Pereira de Souza CBMEG e DGE / UNICAMP
  • Luciana Lasry Benchimol Instituto Agromico

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2008.v43.765

Keywords:

<i>Phaseolus vulgaris</i>, molecular markers, plant breeding, QTL, SSR

Abstract

The objective of this work was to develop new microsatellite markers in common bean. Ninety nine new microsatelitte loci were developed from a microsatellite enriched library for (CT)8 and (GT)8 motifs, from CAL-143 line. The majority of microsatellite sequences (51%) was related to cellular metabolism. The remaining sequences were associated to transcription functions. Only 17.2% of the sequences presented some level of similarity with other plant species genes.

Author Biographies

Juliana Morini Kupper Cardoso, Instituto Agronômico

Aluna do programa de pós-graduação nível Mestrado do curso de Agricultura Tropical e Subtropical, área de concentração genética, melhoramento vegetal e biotecnologia, bolsista FAPESP. O trabalho corresponde aos dados obtidos em sua Iniciação Científica.

Paula Rodrigues Oblessuc, Departamento de Genética e Evolução/ UNICAMP

Biológa formada pela UNICAMP, e aluna do curso de pós-gradução do Departamento de Genética e Evolução do Instituto de Biologia, UNICAMP nível mestrado.

Tatiana de Campos, CBMEG e DGE / UNICAMP

Bióloga formada pela USP, aluna de Doutorado do curso de Pós-graduação de Genética e Evolução do Instituto de Biologia da UNICAMP.

Danilo Augusto Sforça, CBMEG, UNICAMP

Estudante de Biologia da UNICAMP e bolsista de IC da FAPESP, trabalhando atualmente no laboratório de análises genéticas e moleculares do CBMEG/UNICAMP.

Sérgio Augusto Morais Carbonell, Instituto Agronômico

Bolsista CNPq. Possui graduação em Agronomia pela Universidade Federal de Santa Maria (1987), mestrado em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Estadual de Londrina (1991) e doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas) pela ESALQ - Universidade de São Paulo (1995). Atualmente é pesquisador científico VI do Instituto Agronômico de Campinas e líder de Pesquisa em Melhoramento nesta Instituição. Professor Permanente do Curso em Agricultura Tropical e Subtropical, Área de concentração em Genética, Melhoramento Vegetal e Biotecnologia do IAC e Coordenador da PG do Conselho desta área. Tem experiência na área de Agronomia, com ênfase em MELHORAMENTO DO FEIJOEIRO, atuando principalmente nos seguintes temas: melhoramento genético, feijoeiro, resistencia a doenças e pragas, recomendação de cultivares, qualidade tecnológica do feijoeiro, avaliação genética, molecular e agronômica de germoplasma e seleção de progênies por meio agronômico, fitopatógenos e com uso de marcadores moleculares.

Alisson Fernando Chioratto, Instituto Agronômico

Pesquisador científico nível I do Centro de Grãos e Fibras, do Instituto Agronômico de campinas, área de concentração no melhoramento do feijoeiro.

Eduardo Fernandes Formighieri, LGE, UNICAMP

possui graduação em Engenharia Agronômica pela Universidade de São Paulo (1998) , mestrado em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura) pela Universidade de São Paulo (2002) e doutorado em Biologia Funcional e Molecular pela Universidade Estadual de Campinas (2006) . Atualmente é Coordenador de Pesquisa em Bioinformática da CanaVialis S. A.. Tem experiência na área de Bioquímica , com ênfase em Biologia Molecular. Atuando principalmente nos seguintes temas: genomas, sequenciamento, proteínas.

Anete Pereira de Souza, CBMEG e DGE / UNICAMP

Anete Pereira de Souza concluiu o curso de Engenharia Agronômica na ESALQ/USP em 1984 e o doutorado em Biologia Celular e Molecular - Universite de Paris XI (Paris-Sud) em 1992. Atualmente é Professor Titular do Departamento de Genética e Evolução da Universidade Estadual de Campinas, na área de genética Vegetal. Atua principalmente nas áreas de Genética Vegetal e Biologia Molecular, com ênfase em Mapeamento Genético Molecular, Análise da Diversidade Genética e Estrutura e Expressão de Proteínas Relacionadas à Fitopatogenicidade.

Luciana Lasry Benchimol, Instituto Agromico

Possui bacharelado e licenciatura em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Campinas, modalidade molecular (1993), mestrado em Genética Vegetal pelo Departamento de Genética e Evolução / UNICAMP (1996), doutorado em Genética e Biologia Molecular pelo Departamento de Genética e Evolução / UNICAMP (2002), e pós-doutorado em desenvolvimento de microssatélites para feijão comum pelo CBMEG/UNICAMP e IAC/Campinas (2004). Desde de 2005, é pesquisadora científica do Centro de Pesquisa e Desenvolvimento em Recursos Genéticos Vegetais do Instituto Agronômico de Campinas. Participa desde 2006, como docente permanente do curso de pós-graduação em Agricultura Tropical e Subtropical, área de Genética, Melhoramento Vegetal e Biotecnologia do IAC. Tem experiência na área de marcadores moleculares aplicados ao melhoramento com ênfase no melhoramento do feijoeiro, mapeamento de genes ligados a resistência a doenças, seleção assistida por marcadores, caracterização de germoplasma e desenvolvimento de microssatélites.

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Published

2008-10-28

How to Cite

Cardoso, J. M. K., Oblessuc, P. R., Campos, T. de, Sforça, D. A., Carbonell, S. A. M., Chioratto, A. F., … Benchimol, L. L. (2008). New microsatellite markers developed from an enriched microsatellite common bean library. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, 43(7), 929–936. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2008.v43.765

Issue

v.43, n.7, jul. 2008

Section

SCIENTIFIC NOTES