Caracterização molecular de cultivares de cebola com marcadores microssatélites

Autores

  • Carlos Antonio Fernandes Santos Embrapa
  • Valter Rodrigues Oliveira Embrapa
  • Marciene Amorim Rodrigues UEFS
  • Hugo Leonardo Coelho Ribeiro Embrapa

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2010.v45.7368

Palavras-chave:

Allium cepa, dendrograma, similaridade, SSR

Resumo

O objetivo deste trabalho foi estabelecer padrões alélicos e estimar as distâncias genéticas baseadas em marcador SSR de 44 cultivares de cebola adaptadas às condições de cultivo tropicais e subtropicais do Brasil. Para visualização da similaridade genética, utilizou-se o dendrograma UPGMA gerado da matriz de distâncias do coeficiente de Jaccard, com base em 40 alelos de 13 locos SSR. O DNA total foi extraído pelo método CTAB 2x, e os produtos de PCR foram analisados em géis de poliacrilamida desnaturante 6% e corados com nitrato de prata. O número de pares de bases foi estimado pelo método da mobilidade inversa, com base em regressão de produtos de tamanho conhecido. A média da heterozigosidade dos locos SSR foi 0,58. Os 40 alelos dos 13 locos SSR foram suficientes para distinguir as 44 cultivares de cebola. O maior número de alelos em comum foi observado entre as cultivares Yellow Granex e Henry's Special PRR e o menor, entre as cultivares Baia Periforme Super Precoce e Excel. Os sete grupos principais de cultivares identificados no dendrograma apresentaram concordância com a genealogia conhecida e o tipo agronômico das cultivares avaliadas. Os locos SSR selecionados são adequados para melhoramento e proteção de cultivares da espécie.

Biografia do Autor

  • Carlos Antonio Fernandes Santos, Embrapa
    E
  • Valter Rodrigues Oliveira, Embrapa
    Engo. Agronomo, Doutor, Embrapa Hortaliças
  • Marciene Amorim Rodrigues, UEFS
    Mestranda em Biotecnologia, UEFS. Laboratório de Genética Embrapa Semiárido
  • Hugo Leonardo Coelho Ribeiro, Embrapa
    Mestrando em RGV, UEFS. Laboratório de Genética Embrapa Semiárido

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Publicado

2010-12-28

Edição

Seção

GENÉTICA

Como Citar

Santos, C. A. F., Oliveira, V. R., Rodrigues, M. A., & Ribeiro, H. L. C. (2010). Caracterização molecular de cultivares de cebola com marcadores microssatélites. Pesquisa Agropecuária Brasileira, 45(1), 49-55. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2010.v45.7368

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