Seleção e associação genômica ampla para o melhoramento genético animal com uso do método ssGBLUP

Autores

  • Simone Fernanda Nedel Pértile Universidade de São Paulo, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Departamento de Zootecnia, Avenida Pádua Dias, no 11, CEP 13418‑900 Piracicaba, SP
  • Fabyano Fonseca e Silva Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Zootecnia, Rua P.H. Rolfs, Centro, CEP 36570‑000 Viçosa, MG
  • Mayara Salvian Universidade de São Paulo, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Departamento de Zootecnia, Avenida Pádua Dias, no 11, CEP 13418‑900 Piracicaba, SP
  • Gerson Barreto Mourão Universidade de São Paulo, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Departamento de Zootecnia, Avenida Pádua Dias, no 11, CEP 13418‑900 Piracicaba, SP

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2016.v51.21832

Palavras-chave:

coeficiente de parentesco, habilidade preditiva, herdabilidade, validação cruzada

Resumo

O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do método ssGBLUP quanto à seleção e à associação genômica ampla, com atribuição de pesos a marcadores genéticos e uso de informações de genótipos e fenótipos, com ou sem informações de pedigree, com diferentes coeficientes de herdabilidade. A população estudada foi obtida por simulação de dados com 8.150 animais, 5.850 dos quais eram genotipados. Utilizou-se o método ssGBLUP para a análise dos dados, com duas matrizes de relacionamento – com ou sem informações de pedigree –, e pesos para os marcadores genéticos obtidos em cada iteração. O aumento do coeficiente de herdabilidade melhorou os resultados de seleção e associação genômica. O melhor desempenho quanto à habilidade preditiva foi obtido quando não se utilizaram informações de pedigree. O tipo de matriz de relacionamento utilizada não influenciou a identificação de regiões associadas a características de interesse. O método ssGBLUP é eficiente tanto para a seleção quanto para a identificação de regiões associadas às características estudadas.

Downloads

Publicado

2016-12-02

Como Citar

Pértile, S. F. N., Silva, F. F. e, Salvian, M., & Mourão, G. B. (2016). Seleção e associação genômica ampla para o melhoramento genético animal com uso do método ssGBLUP. Pesquisa Agropecuária Brasileira, 51(10), 1729–1736. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2016.v51.21832

Edição

Seção

GENÉTICA