Desenvolvimento de marcadores SNP para triagem de produtividade de grãos de cultivares brasileiras de arroz

Autores

  • Gabriel Feresin Pantalião Embrapa Arroz e Feijão, Rodovia GO-462, Km 12, CEP 75375-000 Santo Antônio de Goiás, GO.
  • Rosana Pereira Vianello Embrapa Arroz e Feijão, Rodovia GO-462, Km 12, CEP 75375-000 Santo Antônio de Goiás, GO.
  • Luíce Gomes Bueno Embrapa Caprinos e Ovinos, Estrada Sobral-Groaíras, Km 4, CEP 62010-970 Sobral, CE.
  • João Antônio Mendonça Embrapa Arroz e Feijão, Rodovia GO-462, Km 12, CEP 75375-000 Santo Antônio de Goiás, GO.
  • Alexandre Siqueira Guedes Coelho Universidade Federal de Goiás, Escola de Agronomia, Rodovia GO-462, Km 0, CEP 74690-900 Goiânia, GO.
  • Antônio Carlos Centeno Cordeiro Embrapa Roraima, Rodovia BR-174, Km 8, CEP 69301-970 Boa Vista, RR.
  • Paula Arielle Valdisser Embrapa Arroz e Feijão, Rodovia GO-462, Km 12, CEP 75375-000 Santo Antônio de Goiás, GO.
  • Ariadna Faria Vieira Embrapa Arroz e Feijão, Rodovia GO-462, Km 12, CEP 75375-000 Santo Antônio de Goiás, GO.
  • Claudio Brondani Embrapa Arroz e Feijão, Rodovia GO-462, Km 12, CEP 75375-000 Santo Antônio de Goiás, GO.

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2020.v55.26692

Palavras-chave:

Oryza sativa, GWAS, seleção assistida por marcadores, produtividade

Resumo

O objetivo deste trabalho foi identificar e validar marcadores de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) relacionados à produtividade de grãos em coleção nuclear de arroz (Oryza sativa). A metodologia de estudos de associação genômica ampla (GWAS) foi aplicada à genotipagem de 541 genótipos por 167.470 SNPs. A produtividade de grãos desses acessos foi estimada por meio da análise conjunta de nove experimentos de campo, realizados em seis estados brasileiros. Quinze SNPs foram significativamente associados à produtividade de grãos e, dos dez SNPs que foram convertidos em ensaios TaqMan, quatro discriminaram os acessos com maior produtividade. Esses marcadores foram utilizados para identificar aceessos de arroz com os alelos favoráveis. Em seguida, os acessos selecionados foram avaliados em experimentos de campo, em ambientes-alvo, para identificar os mais produtivos. Essa triagem reduz o número de acessos avaliados experimentalmente, pois torna possível priorizar aqueles com maior potencial produtivo, o que permite aumentar o número de repetições e, consequentemente, a precisão experimental.

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Publicado

2020-07-02

Como Citar

Pantalião, G. F., Vianello, R. P., Bueno, L. G., Mendonça, J. A., Coelho, A. S. G., Cordeiro, A. C. C., … Brondani, C. (2020). Desenvolvimento de marcadores SNP para triagem de produtividade de grãos de cultivares brasileiras de arroz. Pesquisa Agropecuária Brasileira, 55(X), e01643. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2020.v55.26692

Edição

V.55, Jan./Dec., 2020: Publicação contínua em volume anual

Seção

GENÉTICA