New microsatellite markers developed from an enriched microsatellite common bean library

Authors

  • Juliana Morini Kupper Cardoso Instituto Agronômico
  • Paula Rodrigues Oblessuc Departamento de Genética e Evolução/ UNICAMP
  • Tatiana de Campos CBMEG e DGE / UNICAMP
  • Danilo Augusto Sforça CBMEG, UNICAMP
  • Sérgio Augusto Morais Carbonell Instituto Agronômico
  • Alisson Fernando Chioratto Instituto Agronômico
  • Eduardo Fernandes Formighieri LGE, UNICAMP
  • Anete Pereira de Souza CBMEG e DGE / UNICAMP
  • Luciana Lasry Benchimol Instituto Agromico

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2008.v43.765

Keywords:

<i>Phaseolus vulgaris</i>, molecular markers, plant breeding, QTL, SSR

Abstract

The objective of this work was to develop new microsatellite markers in common bean. Ninety nine new microsatelitte loci were developed from a microsatellite enriched library for (CT)8 and (GT)8 motifs, from CAL-143 line. The majority of microsatellite sequences (51%) was related to cellular metabolism. The remaining sequences were associated to transcription functions. Only 17.2% of the sequences presented some level of similarity with other plant species genes.

Author Biographies

  • Juliana Morini Kupper Cardoso, Instituto Agronômico
    Aluna do programa de pós-graduação nível Mestrado do curso de Agricultura Tropical e Subtropical, área de concentração genética, melhoramento vegetal e biotecnologia, bolsista FAPESP. O trabalho corresponde aos dados obtidos em sua Iniciação Científica.
  • Paula Rodrigues Oblessuc, Departamento de Genética e Evolução/ UNICAMP
    Biológa formada pela UNICAMP, e aluna do curso de pós-gradução do Departamento de Genética e Evolução do Instituto de Biologia, UNICAMP nível mestrado.
  • Tatiana de Campos, CBMEG e DGE / UNICAMP
    Bióloga formada pela USP, aluna de Doutorado do curso de Pós-graduação de Genética e Evolução do Instituto de Biologia da UNICAMP.
  • Danilo Augusto Sforça, CBMEG, UNICAMP
    Estudante de Biologia da UNICAMP e bolsista de IC da FAPESP, trabalhando atualmente no laboratório de análises genéticas e moleculares do CBMEG/UNICAMP.
  • Sérgio Augusto Morais Carbonell, Instituto Agronômico
    Bolsista CNPq. Possui graduação em Agronomia pela Universidade Federal de Santa Maria (1987), mestrado em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Estadual de Londrina (1991) e doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas) pela ESALQ - Universidade de São Paulo (1995). Atualmente é pesquisador científico VI do Instituto Agronômico de Campinas e líder de Pesquisa em Melhoramento nesta Instituição. Professor Permanente do Curso em Agricultura Tropical e Subtropical, Área de concentração em Genética, Melhoramento Vegetal e Biotecnologia do IAC e Coordenador da PG do Conselho desta área. Tem experiência na área de Agronomia, com ênfase em MELHORAMENTO DO FEIJOEIRO, atuando principalmente nos seguintes temas: melhoramento genético, feijoeiro, resistencia a doenças e pragas, recomendação de cultivares, qualidade tecnológica do feijoeiro, avaliação genética, molecular e agronômica de germoplasma e seleção de progênies por meio agronômico, fitopatógenos e com uso de marcadores moleculares.
  • Alisson Fernando Chioratto, Instituto Agronômico
    Pesquisador científico nível I do Centro de Grãos e Fibras, do Instituto Agronômico de campinas, área de concentração no melhoramento do feijoeiro.
  • Eduardo Fernandes Formighieri, LGE, UNICAMP
    possui graduação em Engenharia Agronômica pela Universidade de São Paulo (1998) , mestrado em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura) pela Universidade de São Paulo (2002) e doutorado em Biologia Funcional e Molecular pela Universidade Estadual de Campinas (2006) . Atualmente é Coordenador de Pesquisa em Bioinformática da CanaVialis S. A.. Tem experiência na área de Bioquímica , com ênfase em Biologia Molecular. Atuando principalmente nos seguintes temas: genomas, sequenciamento, proteínas.
  • Anete Pereira de Souza, CBMEG e DGE / UNICAMP
    Anete Pereira de Souza concluiu o curso de Engenharia Agronômica na ESALQ/USP em 1984 e o doutorado em Biologia Celular e Molecular - Universite de Paris XI (Paris-Sud) em 1992. Atualmente é Professor Titular do Departamento de Genética e Evolução da Universidade Estadual de Campinas, na área de genética Vegetal. Atua principalmente nas áreas de Genética Vegetal e Biologia Molecular, com ênfase em Mapeamento Genético Molecular, Análise da Diversidade Genética e Estrutura e Expressão de Proteínas Relacionadas à Fitopatogenicidade.
  • Luciana Lasry Benchimol, Instituto Agromico
    Possui bacharelado e licenciatura em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Campinas, modalidade molecular (1993), mestrado em Genética Vegetal pelo Departamento de Genética e Evolução / UNICAMP (1996), doutorado em Genética e Biologia Molecular pelo Departamento de Genética e Evolução / UNICAMP (2002), e pós-doutorado em desenvolvimento de microssatélites para feijão comum pelo CBMEG/UNICAMP e IAC/Campinas (2004). Desde de 2005, é pesquisadora científica do Centro de Pesquisa e Desenvolvimento em Recursos Genéticos Vegetais do Instituto Agronômico de Campinas. Participa desde 2006, como docente permanente do curso de pós-graduação em Agricultura Tropical e Subtropical, área de Genética, Melhoramento Vegetal e Biotecnologia do IAC. Tem experiência na área de marcadores moleculares aplicados ao melhoramento com ênfase no melhoramento do feijoeiro, mapeamento de genes ligados a resistência a doenças, seleção assistida por marcadores, caracterização de germoplasma e desenvolvimento de microssatélites.

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Published

2008-10-28

Issue

v.43, n.7, jul. 2008

Section

SCIENTIFIC NOTES

How to Cite

Cardoso, J. M. K., Oblessuc, P. R., Campos, T. de, Sforça, D. A., Carbonell, S. A. M., Chioratto, A. F., Formighieri, E. F., Souza, A. P. de, & Benchimol, L. L. (2008). New microsatellite markers developed from an enriched microsatellite common bean library. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, 43(7), 929-936. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2008.v43.765