Caracterização molecular de cultivares de cebola com marcadores microssatélites

Autores

  • Carlos Antonio Fernandes Santos Embrapa
  • Valter Rodrigues Oliveira Embrapa
  • Marciene Amorim Rodrigues UEFS
  • Hugo Leonardo Coelho Ribeiro Embrapa

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2010.v45.7368

Palavras-chave:

Allium cepa, dendrograma, similaridade, SSR

Resumo

O objetivo deste trabalho foi estabelecer padrões alélicos e estimar as distâncias genéticas baseadas em marcador SSR de 44 cultivares de cebola adaptadas às condições de cultivo tropicais e subtropicais do Brasil. Para visualização da similaridade genética, utilizou-se o dendrograma UPGMA gerado da matriz de distâncias do coeficiente de Jaccard, com base em 40 alelos de 13 locos SSR. O DNA total foi extraído pelo método CTAB 2x, e os produtos de PCR foram analisados em géis de poliacrilamida desnaturante 6% e corados com nitrato de prata. O número de pares de bases foi estimado pelo método da mobilidade inversa, com base em regressão de produtos de tamanho conhecido. A média da heterozigosidade dos locos SSR foi 0,58. Os 40 alelos dos 13 locos SSR foram suficientes para distinguir as 44 cultivares de cebola. O maior número de alelos em comum foi observado entre as cultivares Yellow Granex e Henry's Special PRR e o menor, entre as cultivares Baia Periforme Super Precoce e Excel. Os sete grupos principais de cultivares identificados no dendrograma apresentaram concordância com a genealogia conhecida e o tipo agronômico das cultivares avaliadas. Os locos SSR selecionados são adequados para melhoramento e proteção de cultivares da espécie.

Biografia do Autor

Carlos Antonio Fernandes Santos, Embrapa

E

Valter Rodrigues Oliveira, Embrapa

Engo. Agronomo, Doutor, Embrapa Hortaliças

Marciene Amorim Rodrigues, UEFS

Mestranda em Biotecnologia, UEFS. Laboratório de Genética Embrapa Semiárido

Hugo Leonardo Coelho Ribeiro, Embrapa

Mestrando em RGV, UEFS. Laboratório de Genética Embrapa Semiárido

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Publicado

2010-12-28

Como Citar

Santos, C. A. F., Oliveira, V. R., Rodrigues, M. A., & Ribeiro, H. L. C. (2010). Caracterização molecular de cultivares de cebola com marcadores microssatélites. Pesquisa Agropecuária Brasileira, 45(1), 49–55. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2010.v45.7368

Edição

Seção

GENÉTICA