Quantification of the diversity among common bean accessions using Ward-MLM strategy

Authors

  • Pablo Diego Silva Cabral Universidade Estadual do Norte Fluminense
  • Taís Cristina Bastos Soares Universidade Federal do Espírito Santo
  • Leandro Simões Azeredo Gonçalves Universidade Estadual do Norte Fluminense
  • Antonio Teixeira do Amaral Júnior Universidade Estadual do Norte Fluminense
  • Andreia Barcelos Passos Lima Universidade Federal do Espírito Santo
  • Rosana Rodrigues
  • Frederico de Pina Matta Universidade Federal do Espírito Santo

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2010.v45.8540

Keywords:

Phaseolus vulgaris, genetic diversity, germplasm characterization, joint analysis, molecular markers, morphological markers

Abstract

The present work aimed at evaluating the divergence among common bean accessions by their agronomic, morphological and molecular traits, based on the Ward-MLM procedure. A collection of 57 accessions from the gene bank of Universidade Federal do Espírito Santo was used in this study, from which: 31 were landraces belonging to the community Fortaleza, in the municipality of Muqui, ES, Brazil; 20 accessions were provided by Embrapa Trigo; and 6 were commercial cultivars. Five agronomic traits (plant cycle, number of seeds per pod, number of pods per plant, weight of 100 seeds, and grain yield), five morphological traits (growth habit, plant size, seed shape, seed color, and commercial group) and 16 microsatellite primers were evaluated. High genetic variability was detected considering morphological, agronomic and molecular traits in the 57 common bean accessions studied. The Ward-MLM procedure showed that the ideal number of groups was five, according to the pseudo F and pseudo t2 criteria. The accessions from Andean origin had heavier seeds than others and formed a cluster. The Ward-MLM statistical procedure is a useful technique to detect genetic divergence and to cluster genotypes by simultaneously using morphological, agronomic and molecular data.

Author Biographies

Pablo Diego Silva Cabral, Universidade Estadual do Norte Fluminense

Taís Cristina Bastos Soares, Universidade Federal do Espírito Santo

Doutora em Bioquímica Agrícola. pela Universidade Federal de Viçosa. Atualmente é professor adjunto I da Universidade Federal do Espírito Santo. Tem experiência na área de Biologia Molecular, atuando principalmente nos seguintes temas: soja, marcadores moleculares, mapeamento genético, QTLs e seleção assistida.

Leandro Simões Azeredo Gonçalves, Universidade Estadual do Norte Fluminense

Doutor em Genética e Melhoramento de Plantas pela Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.

Antonio Teixeira do Amaral Júnior, Universidade Estadual do Norte Fluminense

Professor Associado da Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF). Bolsista do CNPq desde 2000, publicou 121 artigos em periódicos especializados, além de 131 trabalhos em anais de eventos. Possui 50 itens de produção técnica. Titulou 14 mestres (co-orientou 05, sendo 03 em outra IES pública), 05 doutores (co-orientou 12, sendo um em outra IES pública), 07 bolsistas de iniciação científica e 06 bolsistas de extensão. Supervisionou 01 Pós-doutorando e atualmente supervisiona 02.

Andreia Barcelos Passos Lima, Universidade Federal do Espírito Santo

Tem experiência na área de Biologia Molecular e Cultura de Tecidos Vegetais. Atualmente é profa adjunta da Universidade Federal do Espírito Santo, atuando na área de Biotecnologia Vegetal.Tem experiência na área de Biologia Molecular e Cultura de Tecidos Vegetais. Atualmente é profa adjunta da Universidade Federal do Espírito Santo, atuando na área de Biotecnologia Vegetal.Tem experiência na área de Biologia Molecular e Cultura de Tecidos Vegetais. Atualmente é profa adjunta da Universidade Federal do Espírito Santo, atuando na área de Biotecnologia Vegetal.Tem experiência na área de Biologia Molecular e Cultura de Tecidos Vegetais. Atualmente é profa adjunta da Universidade Federal do Espírito Santo, atuando na área de Biotecnologia Vegetal.

Tem experiência na área de Biologia Molecular e Cultura de Tecidos Vegetais. Atualmente é profa adjunta da Universidade Federal do Espírito Santo, atuando na área de Biotecnologia Vegetal.

 

Frederico de Pina Matta, Universidade Federal do Espírito Santo

Possui graduação em Engenharia Agronômica pela Universidade Federal de Viçosa (1998), mestrado em Genética e Melhoramento pela Universidade Federal de Viçosa (2000) e doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas pela Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (2005). Atualmente é professor Adjunto da Universidade Federal do Espírito Santo. Tem experiência na área de Agronomia, com ênfase em Melhoramento Vegetal, atuando principalmente nos seguintes temas: melhoramento genético e marcadores moleculares.

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Published

2011-01-27

How to Cite

Cabral, P. D. S., Soares, T. C. B., Gonçalves, L. S. A., do Amaral Júnior, A. T., Lima, A. B. P., Rodrigues, R., & Matta, F. de P. (2011). Quantification of the diversity among common bean accessions using Ward-MLM strategy. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, 45(10), 1124–1132. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2010.v45.8540

Issue

Section

GENETICS