Identification of microsatellite markers associated with seed-coat darkening in common bean

Authors

  • Karla Rodrigues Couto Universidade Federal de Lavras
  • João Bosco dos Santos Universidade Federal de Lavras
  • Magno Antônio Patto Ramalho Universidade Federal de Lavras
  • Graciele Simoneti da Silva Universidade Federal de Lavras

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2010.v45.8562

Keywords:

Phaseolus vulgaris, quantitative trait loci, molecular marker, assisted selection, SSR

Abstract

The objective of this work was to indentify microsatellite markers linked to the quantitative trait loci (QTL) responsible for the late seed-coat darkening in the carioca type common bean, in order to reduce the evaluation time spent in selection for this trait. Data of seed-coat darkening of 185 F2:3 progenies derived from the cross VC-3 x 'BRSMG Majestoso', were used. Out of these data, two segregating DNA bulks were constructed to evaluate 444 SSR primers. The applicatives GQMOL and Sisvar were used to evaluate the segregations, elaborate the linkage groups, and to perform single mark and regression analysis (backward method). Eight markers were polymorphic in the DNA bulks. Six of them were mapped in a 80.49-cM linkage group. Out of these six markers, three were very close to the QTL responsible for the late grain darkening. The PVM02TC116 marker co-segregate with that QTL, and the PVESTBR-98 (2.00 cM) and PV176 (12.24 cM) ones flank it, which indicates that high efficiency in the assisted selection is possible.

Author Biographies

Karla Rodrigues Couto, Universidade Federal de Lavras

Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas . 
Universidade Federal de Lavras, UFLA, Brasil. 
Título: IDENTIFICAÇÃO DE MARCADORES MICROSSATÉLITES DE QTL DE FEIJÃO RELACIONADO AO ESCURECIMENTO DE GRÃOS, Ano de Obtenção: 2010. 
Orientador: João Bosco dos Santos. 
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Graduação em Ciências Biológicas . 
Universidade Federal de Lavras, UFLA, Brasil. 
Título: Desenho de Primers para Identificação de Alelos de Resistência de feijoeiro ao Colletotrichum Lindemuthianum. 
Orientador: João Bosco dos Santos. 
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.


João Bosco dos Santos, Universidade Federal de Lavras

Professor titular da Universidade Federal de Lavras, departamento de Biologia, área de Genética e melhoramento de Plantas

Magno Antônio Patto Ramalho, Universidade Federal de Lavras

Professor titular da Universidade Federal de Lavras, departamento de Biologia, área de Genética e melhoramento de Plantas

Graciele Simoneti da Silva, Universidade Federal de Lavras

Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas (Conceito CAPES 5) . 
Universidade Federal de Lavras, UFLA, Brasil. 
Título: Potencial da seleção recorrente no melhoramento do feijoeiro, Ano de Obtenção: 2009. 
Orientador: Magno Antonio Patto Ramalho. 
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, , .

Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas (Conceito CAPES 5) . 
Universidade Federal de Lavras, UFLA, Brasil. 
Título: Controle Genético do escurecimento de feijões do tipo carioca, Ano de Obtenção: 2007. 
Orientador: Magno Antonio Patto Ramalho. 
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, , .

Graduação em Ciências Biológicas . 
Universidade Federal de Mato Grosso, UFMT, Brasil.

Published

2011-01-28

How to Cite

Couto, K. R., Santos, J. B. dos, Ramalho, M. A. P., & Silva, G. S. da. (2011). Identification of microsatellite markers associated with seed-coat darkening in common bean. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, 45(11), 1268–1274. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2010.v45.8562

Issue

Section

GENETICS