Spatial temporal autologistic model with an application to the analysis of spatial patterns of citrus leprosis

Authors

  • Luziane Franciscon Embrapa Suínos e Aves
  • Paulo Justiniano Ribeiro Junior Universidade Federal do Paraná
  • Elias Teixeira Krainski Universidade Federal do Paraná
  • Renato Beozzo Bassanezi Fundecitros
  • Ana Beatriz Costa Czermainski Embrapa Uva e Vinho

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2008.v43.943

Keywords:

<i>Brevipalpus phoenicis, Citrus leprosis virus, Citrus sinensis</i>, spatial statistics, neighbor structures, pseudo‑likelihood

Abstract

The goal of this study was to propose modeling strategies applied to the analysis of citrus leprosis incidence, through the use of a spatial temporal autologistic model. We evaluated the adequacy of autologistic model to consider data collected at different times; to detect spatial-temporal patterns through different neighboring structures; to consider the effect of covariates from previous times; and assessing the effect of the presence of the disease vector in the probability of new infections occurrence. The spatial temporal autologistic model adopted has extended the usual logistic model, in which the neighboring structures is described by means of covariates built from the status of plants nearby, at the same or at previous times. Data regarding the presence of the leprosis on plants were collected at field points referenced in space, over a period of approximately two years. Models detect the presence of spatial patterns on new infections for the studied neighboring structures, at the same or previous time. Additionally, probability estimates of a plant become infected can be obtained from the fitted models, given the occurrence of the disease and vector.

Author Biographies

Luziane Franciscon, Embrapa Suínos e Aves

Possui graduação em Estatística pela Universidade Federal do Paraná (2005). Tem experiência na área de Estatística, atuando principalmente nos seguintes temas: estatística experimental, espacial e modelos de regressão, desenvolvendo projetos junto ao LEG (Laboratŕio de Estatístia e Geoinformação). Mestranda em Estatística e Experimentação Agronômica pela ESALQ/USP (em andamento). Analista em estatística na Embrapa Suínos e Aves (2007).

Paulo Justiniano Ribeiro Junior, Universidade Federal do Paraná

Possui graduação em Agronomia pela Universidade Federal de Lavras, antiga ESAL - Escola Superior de Agricultura de Lavras (1989), mestrado em Agronomia pela Universidade de São Paulo, na ESALQ, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (1992) e doutorado em "Statistics" - University of Lancaster (2002). Atualmente é professor adjunto da Universidade Federal do Paraná. Tem experiência na área de Probabilidade e Estatística, com ênfase em Estatística Espacial, Geoestatística, Estatística Aplicada, atuando principalmente nos seguintes temas: estatística espacial, geoestatística, estatística computacional e inferência bayesiana.

Elias Teixeira Krainski, Universidade Federal do Paraná

Possui graduação em Estatística pela Universidade Federal do Paraná (2005) e mestrado em Estatística pela Universidade Federal de Minas Gerais (2008) . Atualmente é Bolsista CAPES da Universidade Federal de Minas Gerais. Tem experiência na área de Probabilidade e Estatística , com ênfase em Probabilidade e Estatística Aplicadas. Atuando principalmente nos seguintes temas: Estatística espacial.

Renato Beozzo Bassanezi, Fundecitros

Possui graduação em Engenharia Agronômica pela Universidade de São Paulo (1992), mestrado em Agronomia (Fitopatologia) pela Universidade de São Paulo (1996) e doutorado em Agronomia (Fitopatologia) pela Universidade de São Paulo (2000). Atualmente é Pesquisador Científico do Fundo de Defesa da Citricultura. Tem experiência na área de Agronomia, com ênfase em Fitopatologia e Epidemiologia, atuando principalmente nos seguintes temas: doenças de citros e feijoeiro, fitopatologia, epidemiologia e controle.

Ana Beatriz Costa Czermainski, Embrapa Uva e Vinho

Possui graduação em Agronomia pela Universidade Federal de Pelotas (1981) e mestrado e doutorado em Agronomia (respectivamente nas áreas de Estatística e Experimentação Agronômica, em 1987 e Fitopatologia/Epidemiologia, em 2007) pela Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, USP. Docente do Depto. de Matemática e Estatística da UFPel de 1981 a 1989, áreas de Matemática e Estatística. Pesquisadora da Embrapa Uva e Vinho desde 1989. Tem experiência na área de Probabilidade e Estatística, com ênfase em Estatística Experimental, Amostragem e Análise de dados epidemiológicos, atuando principalmente nos seguintes temas: videira, macieira, fruteiras, amostragem em pomares.

Published

2009-01-06

How to Cite

Franciscon, L., Junior, P. J. R., Krainski, E. T., Bassanezi, R. B., & Czermainski, A. B. C. (2009). Spatial temporal autologistic model with an application to the analysis of spatial patterns of citrus leprosis. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, 43(12), 1677–1682. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2008.v43.943

Issue

Section

STATISTICS