Genome-wide association of iron content in rice grains grown in Southern Brazil

Authors

  • Victoria Freitas de Oliveira Universidade Federal de Pelotas, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Departamento de Fitotecnia, Campus Capão do Leão, CEP 96010-610 Capão do Leão, RS.
  • Eduardo Venske Universidade Federal de Pelotas, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Departamento de Fitotecnia, Campus Capão do Leão, CEP 96010-610 Capão do Leão, RS.
  • Cássia Fernanda Stafen Universidade Federal de Pelotas, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Departamento de Fitotecnia, Campus Capão do Leão, CEP 96010-610 Capão do Leão, RS.
  • Fernanda Pollo Paniz Universidade Federal do ABC, Centro de Ciências Naturais e Humanas, Campus Santo André, CEP 09210-580 Santo André, SP.
  • Tatiana Pedron Universidade Federal do ABC, Centro de Ciências Naturais e Humanas, Campus Santo André, CEP 09210-580 Santo André, SP.
  • Rodrigo Mendes Pereira Universidade Federal do ABC, Centro de Ciências Naturais e Humanas, Campus Santo André, CEP 09210-580 Santo André, SP.
  • Ariano Martins de Magalhães Júnior Embrapa Clima Temperado, Estação Experimental Terras Baixas, CEP 96001-970 Capão do Leão, RS.
  • Luciano Carlos da Maia Universidade Federal de Pelotas, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Departamento de Fitotecnia, Campus Capão do Leão, CEP 96010-610 Capão do Leão, RS.
  • Antonio Costa de Oliveira Universidade Federal de Pelotas, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Departamento de Fitotecnia, Campus Capão do Leão, CEP 96010-610 Capão do Leão, RS.
  • Bruno Lemos Batista Universidade Federal do ABC, Centro de Ciências Naturais e Humanas, Campus Santo André, CEP 09210-580 Santo André, SP.
  • Camila Pegoraro Universidade Federal de Pelotas, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Departamento de Fitotecnia, Campus Capão do Leão, CEP 96010-610 Capão do Leão, RS.

Keywords:

Oryza sativa, brown rice, candidate genes, genotyping, mapping

Abstract

The objective of this work was to map the chromosomal regions responsible for iron accumulation in rice grains, in Southern Brazil. Eighty-one rice accessions were genotyped and phenotyped for Fe accumulation. Single nucleotide polymorphisms were mapped in the whole grain on chromosomes 1, 5, 6, and 10, from which 13 candidate genes were identified. Some of the genes, such as Os10g0406800, seem to have a relationship with Fe homeostasis, while others are related to other metabolic processes or have an unknown function.

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Published

2024-03-22

How to Cite

Oliveira, V. F. de, Venske, E., Stafen, C. F., Paniz, F. P., Pedron, T., Pereira, R. M., … Pegoraro, C. (2024). Genome-wide association of iron content in rice grains grown in Southern Brazil. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, 58(AA), e03203. Retrieved from https://apct.sede.embrapa.br/pab/article/view/27466

Issue

V.58, Jan./Dec., 2023 :Continuos publication

Section

GENETICS