Clustering pattern consistency of common bean cultivars by dissimilarity measures and clustering methods

Authors

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2010.v45.4812

Keywords:

<i>Phaseolus vulgaris</i>, clustering algorithms, cophenetic correlation coefficient, dissimilarity measures

Abstract

The objective of this work was to evaluate the clustering pattern consistency in common bean cultivars (Phaseolus vulgaris L.) obtained from the combination of the eight dissimilarity measures and eight clustering methods. Thirteen common bean cultivars were evaluated in nine experiments conducted in the growing seasons between 2000/2001 and 2004/2005 and grouped according to productive (grain yield and number of pods per plant), phenological (number of days between seedling emergence and flowering, and number of days from emergence to harvest) and morphological (height of first pod insertion and height of the final pod insertion) characters. Analyses of variance, correlation, diagnoses of multicollinearity, cluster and comparison of means were carried out. Clustering pattern consistency was evaluated by the cophenetic correlation coefficient. There is variability in the clustering pattern consistency of common bean cultivars, derived from the combination of different dissimilarity measures and clustering methods. Greater clustering pattern consistency in common bean is found with the average linkage between groups method, based on the euclidian distance.

Author Biographies

  • Alberto Cargnelutti Filho, Federal University of Santa Maria
    Alberto Cargnelutti Filho Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2 Alberto Cargnelutti Filho concluiu o doutorado em Agronomia pela Universidade Federal de Santa Maria em 2002. Atualmente é Professor Adjunto I do Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Santa Maria. Atua na área de Estatística Experimental, com ênfase em Técnicas Experimentais, Planejamento de Experimentos, Biometria aplicada ao Melhoramento Genética Vegetal e Climatologia Estatística. Em seu currículo Lattes os termos mais freqüentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: Zea mays L., Phaseolus vulgaris L., avaliação de cultivares, precisão experimental, probabilidade, tamanho de amostra.
  • Nerinéia Dalfollo Ribeiro, Federal University of Santa Maria

    Nerinéia Dalfollo Ribeiro
    Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

    Possui graduação em Agronomia pela Universidade Federal de Santa Maria (1990), mestrado em Agronomia pela Universidade Federal de Santa Maria (1993) e doutorado em Agronomia pela Universidade Federal de Santa Maria (2001). Atualmente é professor associado I e Coordenadora do Programa de Pós-graduação em Agronomia da Universidade Federal de Santa Maria. Tem experiência na área de Agronomia, com ênfase em Genética e Melhoramento de Feijão, atuando principalmente nos seguintes temas: qualidade nutricional e tecnológica, resistência a fatores abióticos e interação genótipo x ambiente.

  • Cláudia Burin, Federal University of Santa Maria

    Cláudia Burin
    Bolsista de Iniciação Científica do CNPq

    É estudante do curso de Engenharia Florestal da Universidade Federal de Santa Maria e bolsista de iniciação científica CNPq no Departamento de Fitotecnia, na área de experimentação vegetal.

Published

2011-01-10

Issue

Section

STATISTICS

How to Cite

Cargnelutti Filho, A., Ribeiro, N. D., & Burin, C. (2011). Clustering pattern consistency of common bean cultivars by dissimilarity measures and clustering methods. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, 45(3), 236-243. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2010.v45.4812

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