Técnicas multivariadas na determinação da diversidade genética em gergelim usando marcadores RAPD

Autores

  • Nair Helena Castro Arriel
  • Antônio Orlando Di Mauro
  • Sônia Marli Zingaretti Di Moura
  • Olaf Abdreas Bakke
  • Sandra Helena Unêda-Trevisoli
  • Marcelo Marchi Costa
  • Andréa Capeloto
  • Amanda Roberta Corrado

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2006.v41.7209

Palavras-chave:

Sesamum indicum, análise de agrupamento, coordenadas principais

Resumo

O objetivo deste trabalho foi comparar diferentes técnicas multivariadas na caracterização de 35 genótipos de gergelim mediante 769 marcadores RAPD. As distâncias genéticas foram obtidas pelo complemento aritmético do coeficiente de Jaccard e agrupadas pelos métodos hierárquicos do vizinho mais próximo, do vizinho mais distante, das médias aritméticas não ponderadas (UPGMA), do método de otimização de Tocher e análises de coordenadas principais. O agrupamento dos genótipos foi alterado em função dos diferentes métodos usados. Adotando-se a mesma distância genética (0,36) como valor de corte, diferenciaram-se quatro grupos no método do vizinho mais próximo, 13 para o vizinho mais distante, 11 no UPGMA e quatro no Tocher. Entre os métodos hierárquicos, o UPGMA apresentou o melhor ajuste das distâncias originais e estimadas (CCC = 0,89). As análises das coordenadas principais confirmaram a baixa diversidade existente entre os genótipos. A maior divergência ocorreu entre as cultivares Seridó 1 e Arawaca 4, e a menor, entre os genótipos VCR-101 e GP-3314. As três primeiras coordenadas principais contabilizaram 35,13% do total da variabilidade, e 18 autovalores foram necessários para explicar 81% da variação genética. Os métodos UPGMA, de otimização de Tocher, e as análises de coordenadas principais são complementares na formação dos grupos.

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Publicado

2006-05-01

Como Citar

Arriel, N. H. C., Mauro, A. O. D., Moura, S. M. Z. D., Bakke, O. A., Unêda-Trevisoli, S. H., Costa, M. M., … Corrado, A. R. (2006). Técnicas multivariadas na determinação da diversidade genética em gergelim usando marcadores RAPD. Pesquisa Agropecuária Brasileira, 41(5), 801–809. https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2006.v41.7209

Edição

Seção

GENÉTICA